阿蘇市の火葬場は、阿蘇中部斎場、阿蘇北部斎場、南阿蘇霊照苑です。いずれも公営斎場なので、係員は寸志（金銭・物品）を受け取ることが禁じられています。阿蘇市は阿蘇広域行政事務組合に加入しており、阿蘇郡南小国町、阿蘇郡小国町、阿蘇郡産山村、阿蘇郡高森町、阿蘇郡南阿蘇村、阿蘇郡西原村と共に阿蘇中部斎場、阿蘇北部斎場、南阿蘇霊照苑を管理しており、住民は利用可能です。火葬場の使用には阿蘇市役所から交付された埋火葬許可証が必要であり、埋火葬許可証の発行を受けるには、阿蘇市役所に死亡診断書／死体検案書（医師による記載・捺印）を提出する必要があります。
故人の印鑑登録証、国民健康保険証、年金証書は使用不能になるので、阿蘇市役所に返却します。
阿蘇市の地元の葬儀会社は、浄心葬祭、JA阿蘇葬祭、清峰院などがあります。阿蘇市の住宅地では家族葬・一日葬・直葬が人気を増しています。