南あわじ市の火葬場は、南あわじ市火葬場、南あわじ市沼島火葬場です。いずれも公営斎場なので、斎場係員は寸志（チップ）を受け取ることが禁じられています。火葬場の使用には南あわじ市役所から交付された死体埋火葬許可証が必要であり、死体埋火葬許可証の発行を受けるには、南あわじ市役所に医師による死亡診断書／死体検案書を提出する必要があります。
故人の印鑑登録証、国民健康保険証、国民年金手帳、後期高齢者医療被保険者証は使用不可になるので、南あわじ市役所に返却します。
南あわじ市に本社・支社のある葬儀社は、花由葬祭店、原口葬儀店、宝積寺葬祭部、いけじり、サン・リガード、丸和、赤松葬祭、南淡祭典、南淡路商事、フジタ屋、ビャクレンなどの会社があります。南あわじ市の住宅地では家族葬・一日葬が需要を増しています。